在北京大学元培学院建立之前,北大曾有过古生物专业。20世纪90年代初,北大的古生物专业开在北京大学地球与空间科学学院,后来因故取消。2008年,元培学院设立古生物专业供学生选择,这是这个本科生培养试点学院的第一个跨学科专业,也让北大成为全国为数不多的开设古生物学本科专业的高校之一。